MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 8495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	CAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018078	TTC	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018078	A	7	7	1654	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018078	TC	4	8	1663	1670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018078	CGG	2	6	1744	1749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018078	AC	4	8	1787	1794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018078	CCGA	2	8	1826	1833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018078	TCG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018078	ACC	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018078	TCG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018078	ATG	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018078	GTT	3	9	2026	2034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018078	CTG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018078	CGT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018078	TCG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018078	GAA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018078	CGA	3	9	9931	9939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018078	GAG	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018078	TCG	2	6	10963	10968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018078	TCC	2	6	11048	11053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018078	ACG	2	6	11078	11083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018078	GGC	2	6	11123	11128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018078	TCG	2	6	11131	11136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018078	CCT	2	6	11184	11189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018078	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_018078	CGG	2	6	11421	11426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018078	ACG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018078	ACC	2	6	11526	11531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018078	ACC	3	9	11596	11604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018078	GCC	2	6	11633	11638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018078	GCAC	2	8	11709	11716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018078	CCG	2	6	11738	11743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018078	CGA	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018078	ACT	2	6	11842	11847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018078	CAT	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018078	GAC	2	6	11964	11969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018078	GCC	2	6	12416	12421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018078	CGG	2	6	12496	12501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018078	GCCC	2	8	12554	12561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_018078	TCG	2	6	13135	13140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018078	CAC	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018078	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_018078	ATTC	2	8	13792	13799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018078	CGG	2	6	13803	13808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018078	GAC	2	6	14133	14138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018078	C	6	6	23308	23313	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_018078	GC	3	6	23324	23329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018078	TCG	2	6	23355	23360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018078	GGT	2	6	23917	23922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018078	TCG	2	6	25577	25582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018078	TCAA	2	8	25615	25622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018078	GAGC	2	8	25643	25650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018078	GGCC	2	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018078	CCG	2	6	25678	25683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018078	CTA	2	6	25713	25718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018078	TCC	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018078	GTT	2	6	25737	25742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018078	TCG	3	9	25857	25865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018078	GCC	2	6	25871	25876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_018078	AAC	2	6	26983	26988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018078	CGT	2	6	27001	27006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018078	CTT	2	6	27052	27057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018078	CGAGC	2	10	27069	27078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018078	CCT	2	6	27551	27556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018078	TA	3	6	27627	27632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018078	GTA	2	6	27666	27671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018078	AC	3	6	29761	29766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018078	GCG	2	6	31184	31189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018078	ACCGCG	2	12	31190	31201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018078	ACCA	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018078	CGG	2	6	31236	31241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018078	CAA	2	6	31271	31276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018078	GAG	2	6	31277	31282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018078	AC	3	6	32096	32101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018078	CAC	2	6	32106	32111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018078	GAT	2	6	32135	32140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018078	TGG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018078	G	6	6	33304	33309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018078	CCGCC	2	10	33909	33918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
80	NC_018078	GCTA	2	8	33956	33963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018078	CGG	2	6	34015	34020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018078	GCG	2	6	34036	34041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018078	TGG	2	6	34097	34102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018078	CGG	2	6	34168	34173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018078	GGT	2	6	34230	34235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018078	CCA	2	6	34252	34257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018078	G	6	6	34292	34297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018078	TCA	2	6	39065	39070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018078	CG	3	6	39086	39091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018078	GC	3	6	39096	39101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018078	CT	3	6	39135	39140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018078	CG	3	6	39142	39147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018078	GC	3	6	39152	39157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018078	CAC	2	6	39932	39937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018078	TCG	2	6	39954	39959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018078	GCC	2	6	41328	41333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018078	GGT	2	6	41389	41394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018078	GAT	2	6	41397	41402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018078	CCG	3	9	42021	42029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018078	AGC	2	6	42040	42045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018078	GCGTC	2	10	42046	42055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018078	GCC	2	6	42470	42475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018078	CGT	2	6	43505	43510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018078	GTG	2	6	43582	43587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018078	CGG	2	6	46581	46586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018078	CGC	2	6	46636	46641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018078	CGG	2	6	46648	46653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018078	CTAC	2	8	47321	47328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018078	GCT	2	6	47438	47443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018078	ATCGG	2	10	47453	47462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018078	GTG	2	6	50102	50107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018078	CCT	2	6	51837	51842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018078	ACG	2	6	51868	51873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018078	AT	3	6	51905	51910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018078	ACA	2	6	51916	51921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018078	TAG	2	6	52808	52813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018078	CTGG	2	8	52818	52825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018078	CCG	2	6	52842	52847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018078	CAA	2	6	52856	52861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018078	GGT	2	6	52880	52885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018078	CGT	2	6	52894	52899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018078	CGC	2	6	58128	58133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018078	TCG	2	6	58137	58142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018078	GGT	2	6	58165	58170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018078	CCT	2	6	58237	58242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018078	AGG	2	6	58275	58280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018078	TGA	2	6	58281	58286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018078	GAA	3	9	58638	58646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018078	GCC	2	6	58655	58660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018078	AGG	2	6	58677	58682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018078	CTC	2	6	60533	60538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018078	ACC	2	6	60566	60571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018078	CGC	2	6	60581	60586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_018078	ACG	2	6	60694	60699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018078	GCC	2	6	60750	60755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018078	GCT	2	6	60773	60778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018078	CGG	2	6	60788	60793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018078	GCC	2	6	60834	60839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018078	CTA	2	6	60848	60853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018078	GCT	2	6	60878	60883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018078	GTG	2	6	60912	60917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018078	GGT	2	6	60959	60964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018078	CG	3	6	60969	60974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018078	ACG	2	6	60988	60993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018078	CGG	2	6	61002	61007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018078	CTG	2	6	61038	61043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018078	CGA	2	6	61048	61053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018078	GGC	2	6	61083	61088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018078	GC	3	6	61092	61097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018078	CGA	2	6	61124	61129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018078	GGC	2	6	61169	61174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018078	GC	3	6	61173	61178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018078	TCT	2	6	61255	61260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018078	CTG	2	6	61296	61301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018078	CGG	2	6	61303	61308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_018078	CGA	2	6	61415	61420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_018078	GC	3	6	61458	61463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_018078	TGA	2	6	61516	61521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018078	AAG	2	6	61530	61535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_018078	AGC	2	6	61644	61649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_018078	GC	3	6	61720	61725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_018078	TGG	2	6	61812	61817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_018078	GCG	2	6	62243	62248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_018078	TGG	2	6	62365	62370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018078	CGA	2	6	62440	62445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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230	NC_018078	CGG	2	6	79586	79591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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237	NC_018078	CGG	2	6	80499	80504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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240	NC_018078	ACC	3	9	80651	80659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
241	NC_018078	CTT	2	6	85740	85745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_018078	GAG	2	6	100701	100706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_018078	GAG	2	6	119918	119923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018078	GCA	2	6	119955	119960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_018078	CTC	2	6	122307	122312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_018078	CGG	2	6	123983	123988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_018078	GC	3	6	124091	124096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_018078	CCT	2	6	124400	124405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_018078	GCACG	2	10	124445	124454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
288	NC_018078	ATCC	2	8	125709	125716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
289	NC_018078	GC	4	8	125758	125765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
290	NC_018078	GCGA	2	8	130797	130804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
291	NC_018078	CGGG	2	8	130840	130847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
292	NC_018078	ACG	2	6	130897	130902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_018078	G	6	6	131005	131010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018078	CGA	2	6	131012	131017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_018078	CGG	2	6	131346	131351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_018078	GCTC	2	8	131352	131359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
297	NC_018078	GGT	2	6	131363	131368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018078	CAA	2	6	133033	133038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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300	NC_018078	ACG	2	6	133993	133998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NC_018078	GAC	2	6	134022	134027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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304	NC_018078	CGGG	2	8	134064	134071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
305	NC_018078	CCG	2	6	136140	136145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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307	NC_018078	TGA	2	6	136207	136212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_018078	GAC	2	6	139878	139883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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324	NC_018078	AGCA	2	8	141224	141231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
325	NC_018078	CGC	2	6	141247	141252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
326	NC_018078	CG	3	6	141276	141281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
327	NC_018078	GAG	2	6	141319	141324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
328	NC_018078	TGT	2	6	144017	144022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_018078	AC	3	6	158020	158025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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420	NC_018078	CA	3	6	196708	196713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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453	NC_018078	G	6	6	230752	230757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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